O secretariado executivo intermunicipal é constituído por um primeiro-secretário e, mediante deliberação unânime do conselho intermunicipal, até dois secretários intermunicipais.
No caso da AMAL, o Secretariado Executivo Intermunicipal é constituído apenas pelo Primeiro-Secretário, que foi eleito pela Assembleia Intermunicipal em 30 de abril de 2018, e iniciou o exercício de funções no dia 2 de maio de 2018, em regime de exclusividade.
Primeiro Secretário: Joaquim Brandão Pires
