O secretariado executivo intermunicipal é constituído por um primeiro-secretário e, mediante deliberação unânime do conselho intermunicipal, até dois secretários intermunicipais.
No caso da AMAL, o Secretariado Executivo Intermunicipal é constituído apenas pelo Primeiro-Secretário, que foi eleito pela Assembleia Intermunicipal em 06 de dezembro de 2021, em regime de exclusividade.
Primeiro Secretário: Joaquim Brandão Pires